Desde 1998, um grupo de professores do Instituto de Geografia vem trabalhando com temas da Geografia Médica, Vigilância em Saúde e Saúde Ambiental, com pesquisas aprovadas em agências de financiamento nacionais e internacionais e, desde essa época, vêm participando de eventos científicos e acadêmicos na área da Geografia da Saúde e Saúde Coletiva.

Em 2000, foi criado o Laboratório de Geografia Médica e, a partir de então, foram criadas nos cursos de graduação e de pós-graduação em Geografia (mestrado e doutorado) disciplinas que abordavam esse tema.

Em 2005, com o apoio da Associação Nacional de Pesquisa e Pós-graduação em Geografia, este grupo criou a revista científica HYGEIA - Revista Brasileira de Geografia Médica e da Saúde: www.hygeia.ig.ufu.br

Em 2009, este grupo apresentou a proposta da criação do curso de graduação Saúde Ambiental, no âmbito do REUNI, que foi aprovado e iniciou com a primeira turma em 2010, sendo o primeiro curso deste tema no Sistema Público de Ensino Superior do Brasil.

Desde 2009 este grupo vem organizando em Uberlândia eventos científicos nacionais e internacionais abrangendo temas vinculados à Geografia Médica e da Saúde, Saúde Ambiental e Promoção da Saúde, como por exemplo: IV Simpósio Nacional de Geografia da Saúde e II Congresso Internacional de Geografia da Saúde (2009); I Simpósio Internacional sobre Saúde Ambiental e a Construção de Cidades Saudáveis (2010); II Simpósio Internacional sobre Saúde Ambiental e a Construção de Cidades Saudáveis em Lisboa (2011); I Simpósio Internacional sobre Território e Promoção da Saúde (2012), além de ajudar a organização de diversos outros eventos no Brasil e no Exterior.

Em 2010, ocorreu a aproximação do grupo de pesquisadores do Laboratório de Geografia Médica com o CEREST Uberlândia, quando iniciou-se uma parceria, que pode ser considerada uma marco fundamental na história da educação continuada e formação em serviço dos trabalhadores da saúde ambiental e da saúde do trabalhador, em Minas Gerais.

O CEREST Uberlândia é a referência regional para a saúde do Trabalhador, em uma área que abrange 29 municípios. A região do Triângulo Mineiro e Alto Paranaíba compreende três CEREST regionais, dos 17 (dezessete) distribuídos pelo estado de Minas Gerais, o que faz com que este curso de mestrado profissional, a ser ofertado pela UFU, tenha uma localização geográfica privilegiada. 

No CEREST, seguindo a orientação do Ministério da Saúde (Decreto Federal 7602, de novembro de 2011), uma das  prioridades é a produção de conhecimento para melhor organização e operacionalização do serviço, assim como a educação permanente para responder às necessidades de capacitação profissional avançada para os trabalhadores vinculados à Rede Nacional de Atenção integral à Saúde do Trabalhador - RENAST. 

Para atender a essa prioridade, consolidada no Plano Municipal de Saúde do Município, referendada pelo Conselho Municipal de Saúde, em 2011, no âmbito desta parceria UFU - CEREST,  foi ofererido aos trabalhadores da Saúde de Uberlândia e região um curso de extensão em Saúde Ambiental e Saúde do Trabalhador (120 horas), com duas turmas de 60 alunos cada. Aquele curso de extensão foi a semente para a criação deste curso de Mestrado Profissional em Saúde Ambiental e Saúde do Trabalhador, que foi proposto à UFU pelo CEREST Uberlândia, em 06/02/2012, por meio do ofício 02/2012 encaminhado ao Maga. Reitor da Universidade Federal de Uberlândia. Imediatamente a isso, iniciaram-se os trabalhos para a elaboração do projeto pedagógico do curso que foi submetido a todas as instâncias de decisão da Universidade, sendo aprovado pelo Conselho Universitário no dia 25 de abril de 2014, por meio da Resolução CONSUN 10/2014, e no dia 22 de dezembro de 2014 o curso foi autorizado pela CAPES.